目前有很多文献报道中草药制剂组分的鉴定，但大部分均局限于目标组分。本文提出了一种新型的、可行的方法通过液相色谱离子阱飞行时间质谱（LC/MS-IT-TOF）来鉴别中草药制剂中非目标组分。本文首次开发了一种简单的程序从实验产生的所有离子中筛选共同的诊断离子。将共享同一种离子（质量偏差<5 mDa）的组分归类为一家族。通过在两个或两个以上的家族中出现的桥接组分，所有的家族都连接成一个连贯的网络。这样一个网络的优点是，一旦有一部分结构得到鉴定，其他化合物的结构可根据其诊断离子进行有效的推断。具有诊断离子的化合物的结构可以作为“前体离子”用于选择包含与主数据库相应的诊断离子亚结构的准确候选物。这种策略能够使数据库搜索范围缩小近7倍，从而大大提高了分析效率和清晰度。运用这种策略，已纳入网络的53个组分中43个已经从所测试的草药制剂中成功鉴定。对于未能用这种策略检测的其于组分，建立了一个互补方法，是通过筛选碎片精确质量差异得出特定化学基团的系列丢失来缩小数据库的搜寻范围。除了未能区分异构体外，结合这两种方法能够成功的识别出检测出的87个峰。本文所开发的方法和途径，对于各种混合物如中草药制剂、生物和环境样品中复杂的非目标成分鉴定是普适的。