由于mRNA对COVID-19疫苗的有效性，关于mRNA的新药发现模式已经受到越来越多的关注。目前获得授权的mRNA疫苗使用体外转录合成，在5'端添加了Cap-1结构（m7GpppRm-）。这种修饰有助于识别mRNA、提高翻译效率和在细胞中保持mRNA稳定性，使得5'帽结构分析成为mRNA质量控制的重要因素。
应用新闻01-00733中介绍的四极杆飞行时间质谱仪可用于SQ不能进行的核酸序列覆盖鉴定。然而，SQ质谱仪易于使用，操作方式与LC相似，因此在确认分子量（如质量控制）方面的需求日益增加因此越来越多地用于确认分子量，例如用于质量控制。以下下面是介绍了使用LCMS-2050 SQ质谱仪和LabSolutions Insight Biologics分析软件进行5’加帽mRNA分析的介绍。