本文建立了一种基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TOF-MS）分析寡核苷酸钠盐分布的方法。通过对单链寡核苷酸引物样品进行加钠处理，分别采用高效液相色谱-质谱（HPLC-MS）与MALDI-TOF-MS进行分析。结果表明，HPLC-MS仅检测到未加盐的单一组分，而MALDI-TOF-MS能够清晰识别加钠后的钠盐分子，且加钠的数目从0~19不等，分布随加盐条件变化。该方法较HPLC-MS具有更高的灵敏度与适应性，能够有效检测寡核苷酸钠盐的分布特征。以反义寡核苷酸药物福米韦森钠为例，MALDI-TOF-MS检测结果显示，福米韦森钠的主体钠盐形式为加合0~3个钠，且基质对检测结果无显著影响。该方法为寡核苷酸钠盐分布的定性分析提供了简便、灵敏的技术手段，对ASO药物的研发与质量控制具有重要应用价值。

治疗性肽的特征是对其功能至关重要的特定氨基酸序列，可以化学合成，类似于小分子药物。合成肽的生产涉及多个步骤，包括脱保护、活化、偶联和从固相支持体上切割最终序列。杂质，例如因过早链终止或缺失氨基酸产生的杂质，会影响最终产品的安全性和有效性，因此，必须通过液相色谱分析分离这些杂质。在液相分析中，选择合适的流动相和色谱柱对于各组分实现最佳分离至关重要，因为它会显著影响分离。然而，由于因肽链长度、氨基酸组成和是否存在修饰导致分离模式差异，因此优化每个肽序列的分离条件很耗时。本研究介绍了如何利用LabSolutions MD（一款支持方法开发的专用软件）在筛选和优化阶段高效地找到有关杂质的最佳分离条件。

21世纪初，抗体药物等生物制药应运而生，但由于其生产工艺采用了基因技术，因此仍有许多挑战需要克服。因此，中分子药物受到重视，肽类药物是中分子药物中的一种，其具有制造成本低，分子量小，易被细胞吸收，进入人体后可通过特定的三维结构防止药物降解等优点，因此，中分子药物目前备受重视。由于此类肽类与小分子药物一样通过化学合成产生，因此有必要对最终合成产物进行纯化、分馏和纯度确认。本文以应用01-00650-EN和01-00651-EN为基础，介绍了使用制备纯化液相色谱仪Nexera Prep（图1）对合成肽进行多步无缝制备纯化工作流程（优化分离条件、放大、分馏和确认纯度/回收率）的案例研究。

本文使用生物惰性超高效液相色谱仪Nexera XS inert与单四极杆质谱LCMS-2050联用，快速分离反义寡核苷酸（ASO）及其杂质，并测定分子量信息。通过优化流动相，2 min内将ASO主成分及杂质分离，通过多电荷解卷积测定ASO主成分和杂质的分子量，从而推断杂质类型。