本文建立了一种使用ATLAS-USIS自动前处理装置及岛津超高效液相色谱仪LC-30A和三重四极杆质谱仪LCMS-8045联用测定尿样中甲基安非他明含量的方法。以外标法定量，校准曲线线性良好，线性相关系数为0.9981。对低、中、高不同浓度的样品平行测试6次，保留时间和峰面积的相对标准偏差分别在0.06 ~ 0.18%和1.06 ~ 4.10%之间，仪器精密度良好，检出限和定量限分别为0.017 ng/mL和0.056 ng/mL。该方法具有自动化程度高、分析速度快、灵敏度高、重现性好的特点，可用于尿样中甲基安非他明含量的测定。

本文使用岛津超高效液相色谱仪LC-30A和三重四极杆质谱仪LCMS-8060与Skyline软件联用建立曲妥珠单抗定量分析方法。通过Skyline软件完成MRM通道的设计和方法的输出，LabSolutions基于Skyline导出的MRM分析方法，进行肽段筛选、碰撞能量优化，最终确认曲妥珠单抗的特征肽段及其对应的MRM离子对。基于以上所建立的方法，本文完成血浆中曲妥珠单抗药物的定量分析方法开发，定量特征肽段为IYPTNGYTR（542.80>404.70），线性范围为0.122 μg/mL~125 μg/mL。

本文建立了一种使用岛津超高效液相色谱仪LC-30A和三重四极杆质谱仪LCMS-8050联用同时测定哺乳动物细胞培养上清液中95种化合物的方法。该方法在17 min内完成95种化合物的分离，分析速度快、重复性好、灵敏度高，适合细胞培养上清液中糖类、氨基酸类、核苷酸类、维生素类和其他类影响因子等化合物的高灵敏度快速检测。

本文建立了一种使用岛津超高效液相色谱仪LC-30A和三重四极杆质谱仪LCMS-8050联用同时测定3种哺乳动物细胞培养基中95种化合物的方法。该方法在17 min内完成95种化合物的分离，分析速度快、重复性好、灵敏度高，适合哺乳动物细胞培养上清液中糖类、氨基酸类、核苷酸类、维生素类和其他类影响因子等化合物的高灵敏度快速检测。

本文建立了一种使用岛津超高效液相色谱仪LC-30A和三重四极杆质谱仪LCMS-8060联用检测猪肉基质中3种多肽类抗生素残留量的检测方法。通过优化的UHPLC-MS/MS条件分析3种多肽物质，采用基质加标曲线定量，在0.5~100 μg/L范围内线性关系良好，相关系数均大于0.999，定量限为0.40~0.70 μg/kg，检出限分别为0.14~0.24 μg/kg；加标回收率在72.9~82.0%之间，日内精密度不超过12.7%，日间精密度不超过13.9%。本方法灵敏度高、准确度好，适用于猪肉中3种多肽类抗生素的测定。

LCMS-8060分析复杂生物基质血浆中小分子药物替比夫定和多肽药物奥曲肽，替比夫定血药浓度10 ng/mL，奥曲肽血药浓度50 pg/mL。日内和日间精密度结果符合《FDA生物分析方法验证指导原则》。长期稳定性结果表明，连续1000次进样的精密度，替比夫定面积RSD% 13.0，替比夫定-D3面积RSD% 4.9，二者面积比RSD% 10.4；连续分析900针的精密度奥曲肽面积RSD% 9.23，内标亮丙瑞林RSD% 7.45，二者面积比RSD% 9.25。结果表明LCMS-8060在复杂生物基质分析中稳定性好，满足生物分析中大样本量长期分析。

本文建立了一种使用岛津高效液相色谱仪LC-20A和三重四极杆质谱仪LCMS-8050联用测定血浆中氨磺必利、阿立哌唑、帕利哌酮和齐拉西酮4种抗精神病药含量的方法。以内标法定量，校准曲线线性良好，线性相关系数均不低于0.9952。对低、中、高不同浓度的样品平行测试6次，保留时间和峰面积的相对标准偏差分别在0.08 ~ 0.63%和0.65 ~ 6.76%之间，仪器检出限和定量限分别为0.003~0.008 ng/mL和0.011~0.025 ng/mL。该方法具有分析速度快、灵敏度高、重复性好的优势，可用于血浆样品中4种抗精神病药含量的检测。

本文建立了一种使用岛津超高效液相色谱仪LC-30A和三重四极杆质谱仪LCMS-8045联用检测鱼肉基质中硝基呋喃类代谢物残留量的检测方法。样品经处理后，用超高效液相色谱LC-30A在3.0 min内完成分离，三重四极杆质谱仪LCMS-8045进行定量分析。3-氨基-2-恶唑酮（AOZ）、5-吗啉甲基-3-氨基-2-恶唑烷基酮(AMOZ)、1-氨基-乙内酰脲(AHD)和氨基脲(SEM)在0.05~20 ng/mL内线性良好，相关系数均大于0.9970；分别用浓度为0.05 ng/mL和2.0 ng/mL的混合标准溶液进行了精密度实验，实验结果表明连续6次进样保留时间和峰面积相对标准偏差分别在0.09~0.18%和0.85~1.99%之间，仪器精密度良好。

本文建立了一种使用岛津超高效液相色谱和三重四极杆质谱联用技术测定SD大鼠血浆中的罗氟司特及其代谢物罗氟司特N-氧化物的方法。SD大鼠血浆样品经乙酸乙酯/正己烷（11）萃取后，可在6 min内快速、准确地测定其中的罗氟司特及罗氟司特N-氧化物。本文考察了方法的线性、定量限、重复性、基质效应与回收率，结果表明罗氟司特及罗氟司特N-氧化物在0.05~25 ng/mL范围内线性良好，相关系数大于0.999；方法定量限为0.05 ng/mL； LLOQ（定量下限）、低、中、高及ULOQ（定量上限）浓度QC样品连续进样6次，其精密度与准确度分别在1.63～12.71 %与103.41～106.57%之间；罗氟司特及罗氟司特N-氧化物低、中、高及ULOQ浓度样品基质效应因子在91.75~101.92 %之间，内标基质效应因子分别为105.67 %（D4-罗氟司特）、103.29 %（D4-罗氟司特N-氧化物）。；回收率在59.10~78.19 %之间，内标回收率为76.93%。

本文使用岛津超高效液相色谱仪LC-30A和三重四极杆质谱仪LCMS-8050与Skyline软件联用初步建立6种蛋白定量分析方法。通过Skyline软件完成MRM通道的设计和方法的输出，LabSolutions基于Skyline导出的MRM分析方法，进行肽段筛选、碰撞能量优化，最终确认蛋白的特征肽段及其对应的MRM离子对。基于以上所建立的方法，本文完成MS QC 混合物中6种蛋白线性关系的考察，以多肽轻链作为线性考察对象，浓度范围分别为Carbonic Anhydrase I (P00915) 0.2~100 fmol/μL、Carbonic Anhydrase II (P00918) 0.2~100 fmol/μL、NAD(P)H dehydrogenase (P15559) 0.4~40 fmol/μL、C-reactive Protein (P02741) 0.2~40 fmol/μL、Peptidyl-Prolyl cis-trans isomerase A (P62937) 0.04~8 fmol/μL、Catalase (P04040) 0.04~8 fmol/μL。